Ključna razlika između DMSO i MSM je u tome što je DMSO spoj organskog sumpora koji postoji u tekućoj fazi, dok je MSM spoj organskog sumpora koji postoji u čvrstoj fazi.
Izraz DMSO označava dimetil sulfoksid, dok izraz MSM označava metilsulfonilmetan. Oboje su organosumporni spojevi. To znaci; ti spojevi imaju atome sumpora vezane za organske spojeve. Glavna razlika između DMSO i MSM leži u fazi tvari u kojoj ti spojevi postoje na sobnoj temperaturi. Uz ovu ključnu razliku postoje i neke druge razlike.