Ključna razlika između Pagetove bolesti i ekcema je ta što je Pagetova bolest žarišni poremećaj pregradnje kostiju, a ekcem je upalno stanje kože koje karakteriziraju skupine vezikularnih lezija s promjenjivim stupnjem eksudata i ljuštenja.
Pagetova bolest nastaje zbog mutacija određenih gena poput nuklearnog faktora kappa B, sekvestosoma p62 i osteoprotegerina. S druge strane, ekcem se javlja kao rezultat reakcija preosjetljivosti postavljenih na različite alergene. Ova razlika u patogenezi glavna je razlika između dviju bolesti.