Ključna razlika između taksonomije i sistematike je u tome što je taksonomija disciplina klasificiranja organizama u svojte uređivanjem na visoko uređen način, dok je sistematika široko područje biologije koje proučava diverzifikaciju vrsta.
Taksonomija i sistematika vrlo su usko povezane discipline u biologiji. Ipak, postoje zanimljive razlike između taksonomije i sistematike. Zbog vrlo bliske sličnosti ove dvojice, mnogi od nas očekivali bi da imaju slična značenja. Stoga je potrebno pomno proučiti ove dvije discipline kako bismo razumjeli stvarnu razliku između taksonomije i sistematike jer mnogi od nas, uključujući osnovne biologe, možda u određenoj zabuni.