Ključna razlika između NMR i rentgenske kristalografije je ta što je NMR analitička tehnika koja se koristi za određivanje vrste i broja atoma u organskoj molekuli, dok je X-zraka kristalografija analitička tehnika koja se koristi za određivanje atomske i molekularne strukture kristala.
Pojam NMR označava nuklearnu magnetsku rezonanciju. Ovaj pojam potpada pod subtopsku spektroskopiju u analitičkoj kemiji. S druge strane, rendgenska kristalografija vrsta je kristalografske tehnike u kojoj za analizu kristala koristimo rendgensku zraku.